1. האגף לחינוך על יסודי - פרויקט לבניית תהליך הוליסטי צומח לטיפול בתלמידים בעלי לקויות למידה. הפרויקט מתחיל בתשס"ה ב 65 חטיבות ביניים בכתות ז'. מבוסס על תכנית בצוותא בתוספת איתור ומיפוי מצבם הלימודי של תלמידי כתות ז' באמצעות ערכת מיפוי מיכ"ל שפותח ברשת אורט בלווי מתל"יות בבתי הספר.
   
   
2. האגף לחינוך יסודי - 42 יישובים מתבצעת תכנית ל"ב היישובים. מושתת על מיפוי קשיי למידה של תלמידים בכתה ג' באמצעות ערכת המיפויי מעק"ב שפותח על ידי ד"ר מיכל שני. הפרויקט מבוסס על עבודה של שתי מורות בכתה בו זמנית לעבודה בקבוצות קטנות על בסיס המיפוי בלווי מדריכות להתאמת אסטרטגיות למידה.
   
   כיום משתתפים בפרויקט 350 כתות כ- 2000 תלמידים
   
   
3. האגף קדם יסודי - תכנית מעג"ן הפרוסה על למעלה מ-30 יישובים מיועדתלהכשרת עם גננות לזיהוי ומיפוי סימנים ראשונים של עיכוב התפתחותי. בהדרכת מדריכות ופסיכולוגים
   
   
4. אגף שח"ר
   
   

• מפתנים ובתי ספר במעבר - בשנת הלימודים תשס"ד ניבנו כלי איתור ייחודיים לאוכלוסיות המפתנים. באמצעותם נעשה מיפוי הקשיים הלימודיים וזיהוי התלמידים בעלי לקות למידה. מדריכות של האגף לווי את תהליך המיפוי בבתי ספר אלו ומדריכות השנה את המורים לבניית אסטרטגיות הוראה ייחודיות לתלמידים של אוכלוסיה זו.
  
  
• מרכזי חינוך וכתות האתגר
  
  
• בשנת תשס"ה יחל קורס משותף של גף לקויות למידה עם אגף שח"ר המיועד להכשיר 35 מתל"יות לעבוד כמאבחנות בבתי הספר. הקורס תלת - שנתי.
  
  
• בניית מרכזי אבחון יישובים - הוצע מודל להקמת מרכזי אתור אבחון וטיפול ב-6 יישובים בארץ והוגש למימון אשלים והג'וינט.