חלק מחופש הדת המוקנה להורים הוא מתן אפשרות לחנך את ילדיהם בהתאם לדת שהם מאמינים בה או להימנע מהקניית חינוך דתי. כדי לממש חופש זה החוק מקנה להורים אפשרות לבחור בין בית ספר ממלכתי, בית ספר ממלכתי-דתי ובית ספר פרטי (חוק חינוך ממלכתי, תשי"ג-1953,סעיף 20) . תקנות לימוד-חובה וחינוך ממלכתי (רישום), התש"יט- 1959, קובעות את נוהלי הרישום של תלמיד לגן או לבית הספר.

העברת תלמיד מבית הספר:

הורים יכולים לבקש העברת תלמיד לבית ספר אחר לאחר רישומו בבית הספר הקרוב. לשם כך נחוצה הסכמה של רשות החינוך המקומית (תקנות חינוך ממלכתי (העברה), התשי"ט- 1959). רשות עשויה לסרב לבקשה מטעמים חינוכיים או מטעמי חיסכון בתקציב.

על סירוב לבקשת העברה רשאים ההורים לערער בכתב בפני מנהל המחוז של משרד החינוך תוך שבוע מיום קבלת ההודעה (סעיף 11א). על החלטת מנהל מחוז שלא לקבל את הערעור, ההורים רשאים להגיש ערעור בכתב למנהל הכללי של המשרד תוך שבוע מיום קבלת ההחלטה. החלטת המנהל הכללי בערעור תהיה סופית (סעיף 11ד).

מנגד, גם מנהל של מוסד רשמי או של רשות חינוך מקומית יכול לדרוש העברה של תלמיד מטעמים חינוכיים, או מטעמי חיסכון בתקציב או מטעמים המחייבים חינוך מיוחד, או אם התלמיד לומד במוסד שלא על-פי סדרי הרישום או שנעשתה העברה שלא בהתאם לאזור הרישום. העברה זו צריכה להתבצע בהסכמת מנהל המחוז (תקנות חינוך ממלכתי (העברה), התשי"ט- 1959, סעיף 6).

זכות ההורים לקבלת מידע הנוגע לתלמיד:

על -פי הנחיית משרד החינוך, יש לדווח להורים על פניית תלמיד ביוזמתו לשיחה עם פסיכולוג בית הספר, אלא אם התלמיד ציין במפורש שאינו מעוניין בכך. אם נתקיימו למעלה משתי שיחות עם הפסיכולוג, יש ליידע את ההורים אפילו בניגוד לרצון התלמיד (חוזר מנכ"ל נא1/ מ- 2 בספטמבר 1990).

ההורים ומנהל בית הספר חייבים לקבל דיווח על כל מקרה רגיש וחמור הנודע לפסיכולוג או למורה יועץ. ההנחיה מציינת כדוגמאות את המקרים הבאים: עבירה על החוק, קיום יחסי- מין על ידי קטין והיריון. ההנחיה מציינת כי רצוי שהעברת המידע תיעשה בהסכמת התלמיד, אך אין היא מחייבת קבלת הסכמה כזו (חוזר מנכ"ל שו9/ מ- 1 במאי 1990).

בית ספר יעדכן מייד את ההורים באירועים חריגים כגון: עבירות משמעת חמורות, קשיים בתפקוד לימודי או חברתי וענייני בריאות (למעט בדיקות איידס), וכן יידע את ההורים בתוכניות הטיפוליות, החינוכיות והמשמעתיות שהוא עומד לנקוט בתגובה לאירוע חריג הקשור לתלמיד. מידע בעייתי, על-פי שיקול הדעת של הצוות המקצועי, יימסר להורים בדרך של פגישה פנים אל פנים ובשיתוף של יועץ או פסיכולוג בית הספר (חוזר מנכ"ל מיוחד י"ז, מאי 1996). למרות הוראות אלה נקבע  בחוזר מנכ"ל זה כי: "כל החלטה שתתקבל במקרה חריג שלא למסור להורים מידע על ילדם, תיעשה בשיתוף מחנך הכיתה, המנהל, היועץ או הפסיכולוג, והיא טעונה תיאום עם היועץ הבכיר או עם הפסיכולוג המחוזי".

זכות ההורים לחיסיון מידע הנוגע לתלמיד: